2003年，吴清源、林海峰、张栩三代旅日棋手回到台湾，当时的台北市长马英九颁给吴清源荣誉市民奖章时，90岁的吴清源拒绝接受，强调：“我是日本人！”

吴清源，姓吴名泉字清源，1914年生于福建，同年移居北京，七岁时由父亲进行围棋启蒙。十一岁父亲辞世，进入段祺瑞府邸当围棋门客，被誉为“围棋天才少年”而扬名北京。14岁东渡日本。吴清源棋艺超群，在空前绝后的十次十番棋中，战胜了全日本所有最顶尖的超级棋士。从此，吴清源成为当之无愧的棋坛第一人，被誉为“昭和棋圣”。 1939年到1956年，被称为“吴清源时代”。吴清源的围棋思想被职业棋手奉为圭臬，被尊为围棋之神。
吴清源在围棋界的地位如何呢？杨振宁这样评价，“爱因斯坦在物理的地位没有吴清源在围棋里高。为什么呢？因为物理里爱因斯坦是第一，但是第二跟爱因斯坦的距离我想没有吴清源和20世纪第二的围棋手的距离那么大。”

吴清源是日本人还是中国人呢？一生之中两次加入日本国籍，连他自己也说不明白。有记者这样问，“您14岁从中国到日本学棋，战前加入日本国籍，战后又加入在台湾的中华民国国籍，晚年又恢复了日本国籍，中日两国经历过近现代的风风雨雨，您的身份认同是怎样的？”
老人用日语说了几句，声音微弱，助手牛力力转述，“吴老师还是说要世界和平，最后大家都要保持好关系。”

1960年，濑越宪作一行访华，周总理特意提到：“下次请一定要带着吴清源一起来中国。我保证让他回日本。”吴清源回忆道：“我本来就是中国人，根本没有回或不回的问题。”

1936年，吴清源加入日本国籍，为的是生存的需要。1979年，吴清源再次加入日本国籍，理由是为了子女就业上学，为了这次申请日本国籍，甚至母亲的葬礼都不参加了。尤其可见，日本身份对吴清源来说多么重要。
吴清源宣称自己，“不语政治，世界无国境”，实际上吴清源不过是个世俗主义者，生存是第一位的。

1932年，吴清源提出加入日本国籍，遭到在日华侨和中国大使馆（加入日本籍必须取消本国籍）的一致反对，资助过他的段祺瑞更是反对，就连其老师濑越先生也并不支持。吴清源最后请日本外交官威胁恐吓中国大使馆才成功的。

吴清源在自传《中的精神》中讲过，“国家处于战乱中，根本不是下棋的年代，”“在当时的中国，光靠围棋是无法生存的。”吴清源在日本每月有二百日圆的生活费，那时日本人大学毕业的工资只有四十日圆。
吴清源的最大争议不在于是不是日本人中国人，而是他曾经为日本军国主义服务过，因此被人骂是“文化汉奸”。

1941年，吴清源参加了棋手组织的“棋道报国会”，通过下棋到军营劳军。1942年应南京“汪伪”政府顾问青木一男的邀请，随同濑越到中国劳军。到达上海以后，饭店旁就有人贴上“杀死问化汉奸吴清源”的标语。

吴清源还鼓吹日本皇国体制，"……寓于“八纮一宇”这四个字的皇祖建国的大精神，也是围棋之道所承袭的传统，这是堂皇而又值得庆幸的。特别是在希望世界和平、坚实地迈步走向大理想的今天， 在建立新体制的同时，棋道更是提升到了国民精神的位置，它完全是依存于我们国体的精华而存在的。而“八纮一宇”的理想，也体现在我们熟悉的棋盘上，因为居中的星位天元，又称作“太极”，如果用以比作金瓯无缺的皇室，天元就是居中支配四方，另八个星位即是“八纮”，在这个空间中进行的棋艺，可以说是最神圣的 娱乐，我们棋士置身其间，应该更深入地体会到这层崭新的意义。“（吴清源《我对围棋的四则认识》，刊于日本棋院机关刊物《棋道》杂志1941年2月号）
围棋是中国的文化，和日本“八纮一宇”八竿子也联系不上，吴清源鼓吹日本皇国体制，难道就是为了证明自己是日本人了吗？

作为一个日本人来说去劳军去鼓吹都是应该的，这是工作而已，但是对中国人而言是难以理解的，为侵华服务就是数典忘祖。
吴清源这样为自己的行为辩护，“我深信天意在于中日友好，并始终没有放弃时代的流向必将转变这一希望。但无论我怎样祈求，这终非我力所能及之事。我信仰的教义中讲到：‘勿谈政治，世界没有国境。’所以我的心情是超越民族，超越国家的。不过，棋迷的士兵时常给我来信，我在给他们的回信中总是写到：‘请不要虐待中国人！’”

“请不要虐待中国人”，这话说得让人感觉这是一个日本人说话的腔调。在日本侵略中国屠杀同胞的时代相信什么“中日友好”，简直就是一个笑话。

说吴清源是汉奸就有点上纲上线了，他毕竟不是像周作人胡兰成那样具体为日本服务的，不过是个日本棋手罢了。
有一点可以肯定，吴清源对抗日是没什么贡献的，更谈不上是爱国主义者。梅兰芳一代名角，蓄须明志不给日本人唱戏。“象棋国手”谢侠逊主动请缨到南洋募捐支援抗日，被誉为“古今以来以象棋报国之一人者”。和他们相比，吴清源境界太低了，全民抗战之时，说什么超越民族国家中日友好，政治上太糊涂幼稚。

吴清源两次加入日本国籍，很明显功利性太强，实用主义。吴在围棋上是神一样的光环，在生活上是凡夫俗子，加入了日本国籍，但是身上的中国血统却是抹不掉的。吴清源去世以后，日本媒体这样评价，“吴清源的神，首先来自于他作为一个华人，却为日本现代围棋奠定了基石”（朝日新闻）
吴清源的女儿吴佳澄说，父亲对世界整体的看法想法，都是从中国传统文化中来的，这是他做事的准则，“他总是说中国的这些古人，谁谁谁怎么说，过去孔夫子怎么说。”

归根到底，是中国的文化基因造就了吴清源的神话。