1、崇拜对象不同。宗教崇拜的是超自然的神，这些神是固定不变的，而邪教崇拜的是活生生的人，即教主本人。邪教教主通常会自称是神的“替身”或“代表”，试图通过神化自己来控制信徒。
2、教义和理论不同。宗教的教义和理论通常与现实世界相融合，提供精神寄托和信仰支持，而邪教的教义通常是歪理邪说，可能会与现实世界对抗，甚至试图控制信徒。
3、活动方式不同。宗教的活动通常是在公开的场所进行，而邪教的活动往往秘密进行，活动地点和时间都具有很大的随意性和隐蔽性。
4、对社会和科学的态度不同。宗教通常倡导信徒融入社会，服务社会，对已经证实的科学事实表示接纳和认同。而邪教则可能反社会、反人类，甚至攻击科学。
5、目的不同。宗教的存在通常是为了追求超越和表达终极关怀，而邪教则可能是为了满足教主的个人私欲或实现其他非法目的。