苏美尔文明同样是发源在两河流域，距今约7000-5千年。在苏美尔传说中，人类的起源是这样的：
天狼星系尼比鲁星球上有一个高度文明，那里的人们寿命有36万年，他们称自己为阿奴那奇人。他们的语言叫阿卡那德语，在这个语言中，阿奴是天，那是与，奇是地。
某一日，尼比鲁星球的质量降低到无法吸引大气，于是阿奴那奇人不得不全银河系地挖掘金矿，填充到尼比鲁星球中加大其质量。阿奴那奇人的首领叫阿努，其他的阿奴那奇人都是他的子孙。阿努将他的儿子恩基（ENKI）派到地球上负责金矿发掘。恩基的意思就是大地之王，他人首蛇身，掌管智慧之树，是水与智慧之神，象征是龙或大蛇。苏美尔神话中，苏美尔人是恩基创造的，因此苏美尔人自称是龙的传人。恩基有一柄神杖，通过它，恩基可以看到并改变生物的最小结构（DNA）。恩基降落到地球后，派了很多低级神明（Igigi)天使去挖金矿。后来天使们觉得工作太辛苦，于是就反叛了。最后为了能够更好地完成工作，恩基创造了一个新物种来代替天使—人类。具体的方法就是用阿奴那奇人自己的DNA与地球上原有生物的DNA结合而产生新物种。恩基在创造人类之前，曾有不少失败的作品，比如恐龙与蜥蜴人。他的弟弟恩利尔（ENLIL）对他的做法并不赞成。恩利尔的意思是风之王、大气之王，他掌管的是灵魂与生命之树。因此苏美尔人认为灵魂是一种气。最后恩基、恩利尔以及妹妹宁胡尔萨格，一起用土、水、气（灵魂）、加上自己的基因创造了人类。宁胡尔萨格掌管生育，同样是人首蛇身。他们最初创造的人是两位，一位男性叫亚当，一位雌雄同体叫莉莉丝。恩利尔对自己的作品十分满意，以至于忘记了创造的初衷是让他们代替天使、蜥蜴人们去挖金矿，还把他们带到伊甸园生活。为此，恩基十分不满，与恩利尔发生了争执。最后恩利尔决定让亚当吉祥待在伊甸园，让莉莉丝去地下挖矿。因为莉莉丝雌雄同体，因此可以自我繁殖，诞生更多的人类。为了让莉莉丝更好地完成挖矿工作，恩基给予了他智慧树的果实。于是莉莉丝有了更高的智慧，并能分辨善恶。但是，就因为如此，莉莉丝开始有了欲望，懂得比较和分辨是非。她觉得阿奴那奇人对待她与亚当的不同做法十分不公。但其实亚当在伊甸园也很孤单。亚当去找恩利尔想要回莉莉丝，但是莉莉丝被阿奴那奇人一致决定派去挖矿，恩利尔无权让她回来。于是恩利尔取了亚当的一根肋骨，造出了夏娃。莉莉丝为此向恩利尔控诉自己不满，恩利尔觉得自己受到冒犯，一怒之下将莉莉丝变为了蛇身。从此莉莉丝就有了人身与蛇身两种形态。莉莉丝自此痛恨阿奴那奇人与亚当夏娃，也觉得自己的悲剧命运都是从智慧树上的果实而来。于是她化成蛇身，绕开认识她的亚当，引诱了素未蒙面的夏娃吃下了智慧树的果实。然后，夏娃也让亚当吃下果实。二人都产生了高等智慧，能分辨善恶，有了欲望与比较之心。恩利尔觉得亚当夏娃的灵魂被污染了，又担心他们有高等智慧后就可以吃生命之树上的果实永远不死，就把他们赶出了伊甸园，让他们到人间继续从事开矿的工作。
所以在苏美尔神话中，人类并不是掌管自然的，而是为了追逐黄金、开发自然资源能源才创造的。
苏美尔神话中也同样有大洪水的传说。在亚当夏娃被赶落地球多年后，恩利尔觉得人类太吵闹，于是放出洪水、干旱和瘟疫来消灭他们。
当时恩利尔觉得人类数量繁殖太多，太吵闹，不但不能好好完成挖矿工作还互相争斗，曾经放出的洪水、干旱和瘟疫来未能完全消灭他们。因为恩基传授人类中一个善良的人阿拉哈西斯灌溉、贮存谷物以及医药的知识，人类因此得以存活下来。恩利尔相当生气，决定秘密召几位神来放一次巨大的洪水完全灭绝人类，但是还是被恩基知道，并且事先安排乌塔那匹兹姆（英语：Utnapishtim）搭船避难，后来还给予乌塔那匹兹姆永生的能力，让他隐居深山。恩利尔大怒，控告恩基妨碍他的计划，恩基则向他解释，为了必须的平衡，不应该完全灭绝无辜的人类，让剩下来的人类进行节育即可。但是，相对地，如果人类不信神祇而堕落，就会任凭众神屠杀。这是大洪水记载的最早版本。 在苏美王表的记载上，也清楚地显示了一场大洪水，根据后世君王在位时间往回推算，可以发现苏美神话中的大洪水距今约2万3000年。在苏美尔神话版的大洪水中，乌塔那匹兹姆将他拥有的一切生物全都推到舟子上;他的全家人及他的亲戚、田里的禽兽、工匠,全都登上舟子。大洪水经历六日六夜，暴雨淹没大地，到第七天,暴雨才止。全人类已为泥泞所覆盖，而舟子则搁在列射山上。乌塔那匹兹姆把一只白鸽放走,过不多时它自行飞回来。后来乌塔那匹兹姆把一只燕子放走,过不多时它又飞回来。因为无法飞往陆地，乌塔那匹兹姆把一只乌鸦放走，这乌鸦飞去后,再没飞回来。